Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Sh3bp2Q06649 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms