Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrx2Q06348 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms