Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox12Q04890 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms