Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Kcnb1Q03717 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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