Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms