Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Thbs2Q03350 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms