Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnnb1Q02248 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms