Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RykQ01887 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RykQ01887 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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RykQ01887 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RykQ01887 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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RykQ01887 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RykQ01887 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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