Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms