Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top2aQ01320 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top2aQ01320 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms