Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Bop1P97452 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms