Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mesp1P97309 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Mesp1P97309 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms