Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tp53bp1P70399 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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