Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad50P70388 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms