Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SeboxP70368 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms