Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pkn1P70268 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pkn1P70268 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pkn1P70268 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pkn1P70268 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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