Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UbdP63072 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UbdP63072 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UbdP63072 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
UbdP63072 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms