Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rps3P62908 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rps3P62908 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms