Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smg6P61406 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms