Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CgnP59242 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CgnP59242 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CgnP59242 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CgnP59242 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms