Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp1P58466 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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