Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
FusP56959 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
FusP56959 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
FusP56959 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms