Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms