Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmoP56726 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SmoP56726 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SmoP56726 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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