Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Irf5P56477 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irf5P56477 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Irf5P56477 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Irf5P56477 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Irf5P56477 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms