Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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