Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PctpP53808 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PctpP53808 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PctpP53808 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PctpP53808 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PctpP53808 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms