Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MipP51180 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MipP51180 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MipP51180 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MipP51180 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms