Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa11P50709 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa11P50709 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms