Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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BckdhaP50136 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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