Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtpreP49446 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PtpreP49446 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PtpreP49446 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtpreP49446 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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