Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrprbP47758 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SrprbP47758 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms