Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myo1bP46735 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myo1bP46735 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms