Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ItgavP43406 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ItgavP43406 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms