Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PtgfrP43117 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms