Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx1-2P42580 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms