Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms