Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtlP38585 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtlP38585 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtlP38585 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms