Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Hoxc11P31313 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxc11P31313 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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