Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pabpc1P29341 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms