Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprmP28828 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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