Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NapbP28663 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NapbP28663 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NapbP28663 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NapbP28663 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NapbP28663 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms