Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lef1P27782 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms