Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NdnP25233 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NdnP25233 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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