Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf239P24399 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Znf239P24399 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms