Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd12P23812 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxd12P23812 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms