Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RarbP22605 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RarbP22605 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RarbP22605 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RarbP22605 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RarbP22605 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RarbP22605 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RarbP22605 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms