Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkcaP20444 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkcaP20444 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms