Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18530 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18530 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18530 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18530 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18530 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18530 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18530 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P18530 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms