Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18528 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18528 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18528 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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